分区格式特性比较
上文介绍了几种常见的文件系统，到底选择哪种文件系统?它们各自有什么优缺点?如何规划部署分区方案(包括分区数目、大小、格式类型)?
基本情况

文件系统	Win95	Win98	WinNT	Win2K/Xp/2003	簇最大数量	最大容量(理论值)	最大容量(Win98)	最大容量(Win2k及其后版本)
FAT16	支持	支持	支持	支持	65535	4Gb	2Gb	4Gb
FAT32	不支持	支持	不支持	支持	4177918	2Tb	127.53Gb	32Gb
NTFS	不支持	不支持	支持	支持	4294967296	16Eb	不支持	2Tb

上表中的相关说明：

表中的“最大容量”为理论值，“可实现最大分区容量”为目前OS可支持的最大容量；
WindowsNT必须先升级到serverpack4或以上的版本才能识别FAT32和Windows2000/XP/2003的NTFS新版本文件系统；
FAT32只是在理论上支持2TB的最大空间，在实现时，Windows98?OSR2/ME　最大只能支持127.53GB，而Windows2000/XP/2003只支持32GB；
16EB等于2~64字节，或等于16384TB；
FAT16在Windows2000/XP/2003系统下可实现的最大格式化容量为4GB(可实现每簇最大容量64KB)
功能支持

文件系统	容错性	长文件名	配额管理	访问权限	加密	更多特性
FAT16	较差	不支持	不支持	不支持	不支持	少
FAT32	较差	支持	不支持	不支持	不支持	一般
NTFS	好	支持	支持	支持	支持	丰富

文件系统优缺点比较

文件系统	优点	缺点
FAT16	MS-dos、Windows95/98/2000/Xp/2003以及一些Unix系统均可使用，兼容性较好。可用来寻址及修复数据的工具很多在小于256Mb的分区中，无论速度还是存储空间利用率都很好。	根文件夹最多只可管理512个项目 FAT16限制只有65536个簇，因此最大分区空间只有4Gb(且只在Windows2000/Xp/2003下才支持4Gb) 引导扇区不能备份
FAT32	与FAT16不同的是，FAT32分区的根文件夹是一个普通的簇链，可定位在分区的任何地方，正因为此，FAT32分区不限制根文件夹的项目数量。 与FAT16相比，FAT32使用更小的簇，从而提高了10%-15%的磁盘空间利用率，能够更有效地使用空间，同时，也减少了操作时的系统资源占用。 FAT32比FAT16更稳定，另外，FAT32分区的引导记录扩展到包括关键数据结构的备份。	Windows2000/Xp/2003可以格式化的FAT32分区限制在32Gb大小。 FAT32分区除了Windows95OSR2/98/2000/Xp/2003外，不可以被其他操作系统直接访问。 引导扇区不能备份
NTFS	可修复性:一旦系统发生故障，NTFS使用其自身的日志文件和检查点信息来自动恢复文件系统的一致性。 压缩:支持对NTFS分区的单个文件压缩。被压缩在NTFS分区的文件可被任意基于Windows的应用程序读写，而不必先对其解压，解压在读取文件时自动进行，当文件被关闭或保存时又再次被压缩。 NTFS的其他优点还包括:具有一些需要NTFS支持才可实现的Windows系统特性；NTFS减少了寻找文件过程中磁盘访问的次数，访问速度较快；在NTFS分区中，可设置文件或文件夹的使用权限来限定只有指定的工作组或用户才可访问，提高了安全性；可以用NTFS格式化最大2Tb的分区；引导扇区被备份到分区尾部的扇区上，等。	NTFS分区在Ms-Dos、Windows9x下不可访问；根据Windows2000/Xp/2003中对NTFS所作升级的高级特性在WindowsNT4.0及以前版本中也不可用。 当较小的分区包含较多小文件时，与FAT相比，管理NTFS的系统资源开销较大，可能会导致性能的降低。